RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584377.5

CSNK1D-222, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 2,891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-222	ENST00000584377	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		14.71	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		14.71	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	RAD54L	Q92698	747 aa		14.71	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	TEKT1	Q969V4	418 aa		14.71	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		14.71	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377		G3V3G9	751 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	IDE	P14735	1019 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	HERVK_113	P62684	666 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	KRT83	P78385	493 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	KCTD1	Q719H9	257 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCDC151	A5D8V7	595 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	USP17L10	C9JJH3	530 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CLGN	O14967	610 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZBTB5	O15062	677 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	IVL	P07476	585 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	TUBB4B	P68371	445 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CTAGE8	P0CG41	777 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	NPR1	P16066	1061 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	NFIA	Q12857	509 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	GPATCH11	Q8N954	259 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	FUT8	Q9BYC5	575 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	MYO6	Q9UM54	1294 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	POTEB2	H3BUK9	544 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	MARCH6	O60337	910 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	AMPD2	Q01433	879 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	BRD3	Q15059	726 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	KCNK18	Q7Z418	384 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	KIAA1328	Q86T90	577 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	DDX12P	Q92771	950 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	TFR2	Q9UP52	801 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377		H3BQF6	201 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	PSMD14	O00487	310 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLURP2	P0DP57	97 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	FIGN	Q5HY92	759 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	HAS1	Q92839	578 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1W2PQJ5	194 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	KRT86	O43790	486 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	RAD21	O60216	631 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	ALDH1B1	P30837	517 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	VWA3B	Q502W6	1294 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	PROM2	Q8N271	834 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	GJA10	Q969M2	543 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	MTMR8	Q96EF0	704 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCDC17	Q96LX7	622 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	NDST4	Q9H3R1	872 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	DEF6	Q9H4E7	631 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	CRK	P46108	304 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	LRRC63	Q05C16	580 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	ECM1	Q16610	540 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	IQCD	Q96DY2	449 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	EHD4	Q9H223	541 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	ENC1	O14682	589 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	PSMD2	Q13200	908 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	PNKP	Q96T60	521 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	RAB21	Q9UL25	225 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CSNK1D-222	ENST00000584377	EHHADH	Q08426	723 aa		14.66	□□□□□ -0.06

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