RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHISA3A0PJX4 238 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TGM5O43548 720 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EOMESO95936 686 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASGR2P07307 311 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HTRA3P83110 453 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT76Q01546 638 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC32Q14392 662 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACAP2Q15057 778 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MORC1Q86VD1 984 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AIFM3Q96NN9 605 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CBLCQ9ULV8 474 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INVSQ9Y283 1065 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANO9A1A5B4 782 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H3BM21 787 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM229AH3BQW9 127 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSTA4O15217 222 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NRDCO43847 1150 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALX3O95076 343 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCRP11274 1271 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GALEQ14376 348 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TESK1Q15569 626 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IQCEQ6IPM2 695 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EFHBQ8N7U6 833 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNJ15Q99712 375 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RRAGCQ9HB90 399 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLHL33A6NCF5 533 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RASSF10A6NK89 507 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 F8W735 103 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H7C1D1 291 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSTM1P09488 218 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHKG2P15735 406 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSPA6P17066 643 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VCAM1P19320 739 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC9A1P19634 815 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRK2P25098 689 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SERPINB3P29508 390 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRK3P35626 688 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRY1Q16526 586 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INF2Q27J81 1249 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR158Q5T848 1215 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPM1EQ8WY54 764 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTC17Q96AE7 1141 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HDAC8Q9BY41 377 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAF1Q9H063 256 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WNT9AO14904 365 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PMM2O15305 246 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AP1G1O43747 822 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LEFTY1O75610 366 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYL3P08590 195 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VSIG8P0DPA2 414 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYBP10242 640 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT15P19012 456 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAMP19021 973 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RXRBP28702 533 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HTR3AP46098 478 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT85P78386 507 aa6.22□□□□□ -1.41
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