RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	BRF1	Q92994	677 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP290	O15078	2479 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	ALPK3	Q96L96	1907 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	CPLX1	O14810	134 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	ADCY6	O43306	1168 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	NEDD9	Q14511	834 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNB2	Q92953	911 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246		A6NJR5	290 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	ADCY7	P51828	1080 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	FPGS	Q05932	587 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.01	□□□□□ -0.33	1e-8	■□□□□ 11
TTLL3-231	ENST00000496246	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	BAD	Q92934	168 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	FIBP	O43427	364 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	CDKL5	O76039	1030 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	TIMP1	P01033	207 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	GNA11	P29992	359 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD1	Q15327	319 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXL16	Q8N461	479 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	BICD2	Q8TD16	824 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA33	Q96N06	139 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	USP26	Q9BXU7	913 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	LCT	P09848	1927 aa		13	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	SMCO2	A6NFE2	343 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	MAFG	O15525	162 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PPFIA4	O75335	1185 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	MMP3	P08254	477 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF76	P36508	570 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	CDK7	P50613	346 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	ANAPC15	P60006	121 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	FAAP100	Q0VG06	881 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	BFSP2	Q13515	415 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	C7orf31	Q8N865	590 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PPTC7	Q8NI37	304 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	COPS5	Q92905	334 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	HIPK3	Q9H422	1215 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	OPLAH	O14841	1288 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	CTAGE5	O15320	804 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	GGPS1	O95749	300 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	XBP1	P17861	261 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMC6	P62333	389 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	AP3B2	Q13367	1082 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	MFSD5	Q6N075	450 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	PRO3102	Q9H379	93 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	BARHL2	Q9NY43	387 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		12.98	□□□□□ -0.33

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