RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPATA5	Q8NB90	893 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	OSBP2	Q969R2	916 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	RILPL2	Q969X0	211 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	MED23	Q9ULK4	1368 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERC2	O15083	957 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC45	O75419	566 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ECEL1	O95672	775 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PF4	P02776	101 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP11A1	P05108	521 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRDX5	P30044	214 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAC1	P63000	192 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTH1R	Q03431	593 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC14	Q15048	493 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	POU4F3	Q15319	338 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	EVI5L	Q96CN4	794 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TINF2	Q9BSI4	451 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRT82	Q9NSB4	513 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0R2C6	588 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SGSM2	O43147	1006 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	GREM1	O60565	184 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELN	P15502	786 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDE6A	P16499	860 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAOB	P27338	520 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNJ4	P48050	445 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	GJA8	P48165	433 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC93	Q567U6	631 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	GORAB	Q5T7V8	394 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PODN	Q7Z5L7	613 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMD1	Q99460	953 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		7.4	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		7.4	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAST3	O60307	1309 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM22	K7EJ46	135 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLGAP3	O95886	979 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SELP	P16109	830 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL8A1	P27658	744 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADD2	P35612	726 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	NLRP12	P59046	1061 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	DACT2	Q5SW24	774 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	VPS53	Q5VIR6	699 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNTROB	Q8N137	903 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPATCH3	Q96I76	525 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF2C	Q99661	725 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CORO1B	Q9BR76	489 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	FSD1	Q9BTV5	496 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP26	Q9BXU7	913 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	COA1	Q9GZY4	146 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHTN1	A0MZ66	631 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM221A	A4D161	298 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKAB2	O43741	272 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ECE2	O60344	883 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	WISP1	O95388	367 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23

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