RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485989.6

TACC3-210, Transcript of transforming acidic coiled-coil containing protein 3, human

TSL 3

Gene TACC3, Length 726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TACC3-210	ENST00000485989	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	CEP290	O15078	2479 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	GRIN2D	O15399	1336 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	MEIS2	O14770	477 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	PSMA5	P28066	241 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	CPT1A	P50416	773 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	CHMP4BP1	P59074	171 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	ARHGAP1	Q07960	439 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	FUT2	Q10981	343 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	AFG1L	Q8WV93	481 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	RGS20	O76081	388 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	GH1	P01241	217 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	MMP3	P08254	477 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	BMP8B	P34820	402 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	CDK7	P50613	346 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	ITGA7	Q13683	1181 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	RUFY3	Q7L099	469 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	CABYR	O75952	493 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	RAG1	P15918	1043 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	NAPA	P54920	295 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	TDH	Q8IZJ6	230 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	PGBD1	Q96JS3	809 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	TOX2	Q96NM4	488 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989		A6NJR5	290 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	STXBP3	O00186	592 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	PIK3CD	O00329	1044 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	KIAA0355	O15063	1070 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	B4GALT4	O60513	344 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	PHKB	Q93100	1093 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	LRCH3	Q96II8	777 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	TBX21	Q9UL17	535 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	GGPS1	O95749	300 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	ZNF286B	P0CG31	522 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	RCAN1	P53805	252 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	EPHB4	P54760	987 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	SP2	Q02086	613 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TACC3-210	ENST00000485989	NID2	Q14112	1375 aa		14.71	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989		A0A1W2PPC1	479 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	CD4	P01730	458 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	STK3	Q13188	491 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	SEMA3F	Q13275	785 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	TMEM260	Q9NX78	707 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	SMCO2	A6NFE2	343 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	ADAMTS3	O15072	1205 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	DTNB	O60941	627 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	SLC34A2	O95436	690 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TACC3-210	ENST00000485989	SEC24B	O95487	1268 aa		14.69	□□□□□ -0.06

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