RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 MICU3Q86XE3 530 aa26.62■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa26.62■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 UMODL1Q5DID0 1318 aa26.62■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 APOA5Q6Q788 366 aa26.61■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 FANCBQ8NB91 859 aa26.61■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.61■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.61■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.6■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 MMP3P08254 477 aa26.6■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 CSF2RAP15509 400 aa26.6■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 CYP2C18P33260 490 aa26.6■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.6■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 KCNB2Q92953 911 aa26.6■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa26.6■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.6■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 KPNA6O60684 536 aa26.59■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 NBPF20Q3BBV1 942 aa26.59■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 C16orf59Q7L2K0 433 aa26.59■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.59■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 HIPK3Q9H422 1215 aa26.59■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 CPA1P15085 419 aa26.58■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 KRT32Q14532 448 aa26.58■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.58■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 DEFB123Q8N688 67 aa26.58■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.856e-8■■■□□ 15
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PSME4-208ENST00000481518 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PSME4-208ENST00000481518 MEIS2O14770 477 aa26.57■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 CCND2P30279 289 aa26.57■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 HSPA4P34932 840 aa26.57■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.849e-7■□□□□ 10.7
PSME4-208ENST00000481518 CYP2C9P11712 490 aa26.56■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 SP2Q02086 613 aa26.56■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.843e-7■■□□□ 14.2
PSME4-208ENST00000481518 FAM47CQ5HY64 1035 aa26.56■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 TMEM199Q8N511 208 aa26.56■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 WNT8AQ9H1J5 351 aa26.56■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.56■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.56■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 PIK3CDO00329 1044 aa26.55■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 SORBS3O60504 671 aa26.55■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 ACRP10323 421 aa26.55■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 NFRKBQ6P4R8 1299 aa26.55■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.55■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 KAT2BQ92831 832 aa26.55■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 CCL23P55773 120 aa26.54■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 FUT2Q10981 343 aa26.54■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 LAMC2Q13753 1193 aa26.54■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 TMEM240Q5SV17 173 aa26.54■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.54■■□□□ 1.84
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PSME4-208ENST00000481518 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.53■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 ZBTB43O43298 467 aa26.53■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 CHMP4BP1P59074 171 aa26.53■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 RTN1Q16799 776 aa26.53■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.53■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 PPTC7Q8NI37 304 aa26.53■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.53■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 GGPS1O95749 300 aa26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 DGKDQ16760 1214 aa26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 HSDL1Q3SXM5 330 aa26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 KCNV1Q6PIU1 500 aa26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 ZNF365Q70YC5 407 aa26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 CUL5Q93034 780 aa26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 IL23AQ9NPF7 189 aa26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PSME4-208ENST00000481518 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 REC8O95072 547 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 ZNF286BP0CG31 522 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 TGFB3P10600 412 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 CDC27P30260 824 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 SEMA3FQ13275 785 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 UBE2SQ16763 222 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 VWCEQ96DN2 955 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.51■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.5■■□□□ 1.83
PSME4-208ENST00000481518 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.5■■□□□ 1.83
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