RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 RGS20O76081 388 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 ST3GAL1Q11201 340 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 TTLL4Q14679 1199 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 BICD2Q8TD16 824 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 WASF1Q92558 559 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 SPC25Q9HBM1 224 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.4■□□□□ 0.86
SMIM4-202ENST00000476842 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 COL6A1P12109 1028 aa20.39■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 MCM2P49736 904 aa20.39■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 NLRP5P59047 1200 aa20.39■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 AP3B2Q13367 1082 aa20.39■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.39■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 AIFM3Q96NN9 605 aa20.39■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.39■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 KBTBD13C9JR72 458 aa20.38■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 ADAMTS3O15072 1205 aa20.38■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 DTNBO60941 627 aa20.38■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 GALNT17Q6IS24 598 aa20.38■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.38■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.38■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 TMEM260Q9NX78 707 aa20.38■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 CTAGE5O15320 804 aa20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 ARIH2O95376 493 aa20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 TGFB3P10600 412 aa20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 XBP1P17861 261 aa20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 TLK2Q86UE8 772 aa20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 ANO3Q9BYT9 981 aa20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 JAK2O60674 1132 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 ICAM3P32942 547 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 LY6KQ17RY6 165 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 GNPTABQ3T906 1256 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 GNASQ5JWF2 1037 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 PGBD1Q96JS3 809 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 ALG1Q9BT22 464 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 PHF24Q9UPV7 400 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 MYADML2A6NDP7 307 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 PTGS1P23219 599 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 SREBF1P36956 1147 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 KCNA10Q16322 511 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 NLRX1Q86UT6 975 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 BLIDQ8IZY5 108 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 COPS5Q92905 334 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 TMX3Q96JJ7 454 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 MCM3APO60318 1980 aa20.35■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 GH1P01241 217 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 ACLYP53396 1101 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 NPY5RQ15761 445 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.34■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 M0R2N6 131 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 MAFGO15525 162 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 FIBPO43427 364 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 ZEB2O60315 1214 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 ASGR1P07306 291 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 CYP3A4P08684 503 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 ITGB5P18084 799 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 BEX3Q00994 111 aa20.33■□□□□ 0.85
SMIM4-202ENST00000476842 ARHGAP1Q07960 439 aa20.33■□□□□ 0.85
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