RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 MCM6Q14566 821 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 TSGA10Q9BZW7 698 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 VPS33BQ9H267 617 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 CPVLQ9H3G5 476 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 ACBD3Q9H3P7 528 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 RIOX1Q9H6W3 641 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 ABCB11O95342 1321 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.21e-7■□□□□ 9.6
OPN3-204ENST00000469376 USP14P54578 494 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 CENPPQ6IPU0 288 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 PIGSQ96S52 555 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 PDE11AQ9HCR9 933 aa28.82■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 FCER1AP12319 257 aa28.81■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 CEP95Q96GE4 821 aa28.81■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 MTMR9Q96QG7 549 aa28.81■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.81■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 UNC13DQ70J99 1090 aa28.81■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 KIAA0895Q8NCT3 520 aa28.81■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 ADAM21Q9UKJ8 722 aa28.81■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 CASP8Q14790 479 aa28.8■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 TMEM266Q2M3C6 531 aa28.8■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 POTEDQ86YR6 584 aa28.8■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 KCNQ5Q9NR82 932 aa28.8■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 GRB10Q13322 594 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 CALCRLQ16602 461 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 RAB34Q9BZG1 259 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 SEMA6BQ9H3T3 888 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 GAKO14976 1311 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 KLK7P49862 253 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 VAV2P52735 878 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 RHBDL3P58872 404 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 LRRC27Q9C0I9 530 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 LRWD1Q9UFC0 647 aa28.79■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 ENC1O14682 589 aa28.78■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 MAP9Q49MG5 647 aa28.78■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 ASPRV1Q53RT3 343 aa28.78■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 SYT17Q9BSW7 474 aa28.78■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 VIPAS39Q9H9C1 493 aa28.78■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 VAT1LQ9HCJ6 419 aa28.78■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa28.78■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.78■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 NFKBIEO00221 500 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 TXKP42681 527 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 PDIA5Q14554 519 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 VWA3BQ502W6 1294 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 MUM1L1Q5H9M0 696 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 FOXR2Q6PJQ5 311 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 NEK11Q8NG66 645 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 USP17L5A8MUK1 530 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 ADCY7P51828 1080 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 KIF5AQ12840 1032 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 SPA17Q15506 151 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 STRIP1Q5VSL9 837 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 LACRTQ9GZZ8 138 aa28.77■■■□□ 2.2
OPN3-204ENST00000469376 IQCEQ6IPM2 695 aa28.76■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 CERS5Q8N5B7 392 aa28.76■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 FAM71BQ8TC56 605 aa28.76■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 CCDC42Q96M95 316 aa28.76■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 PNMA5Q96PV4 448 aa28.76■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 MMS19Q96T76 1030 aa28.76■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 PLAGL2Q9UPG8 496 aa28.76■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.76■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 RCCD1A6NED2 376 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 PDHBP11177 359 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 LRRC63Q05C16 580 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 MAN2A1Q16706 1144 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 SLC39A2Q9NP94 309 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 MED4Q9NPJ6 270 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 TMEM260Q9NX78 707 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 FOCADQ5VW36 1801 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 MYMKA6NI61 221 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 YDJCA8MPS7 323 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 USO1O60763 962 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 PSMD2Q13200 908 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 HSP90B2PQ58FF3 399 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 MXD3Q9BW11 206 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 SUGCTQ9HAC7 445 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 SIK3Q9Y2K2 1263 aa28.75■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 UBA5Q9GZZ9 404 aa28.74■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 NDST4Q9H3R1 872 aa28.74■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 TFR2Q9UP52 801 aa28.74■■■□□ 2.19
OPN3-204ENST00000469376 DACT2Q5SW24 774 aa28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms