RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466247.1

RBM6-215, Transcript of RNA binding motif protein 6, human

TSL 2

Gene RBM6, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM6-215	ENST00000466247	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RBM6-215	ENST00000466247	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RBM6-215	ENST00000466247	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	FOXO4	P98177	505 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	NLRP10	Q86W26	655 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	SEC14L1	Q92503	715 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	DRC1	Q96MC2	740 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247		X6R8D5	127 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	DLX3	O60479	287 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	LCP1	P13796	627 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	MC3R	P41968	323 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	SLC6A11	P48066	632 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	LSAMP	Q13449	338 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	RASA3	Q14644	834 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247		H7BY64	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	INHBB	P09529	407 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	FGFR1	P11362	822 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	BMP7	P18075	431 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	CAP1	Q01518	475 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	RASGRF1	Q13972	1273 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	VMAC	Q2NL98	169 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	MTERF2	Q49AM1	385 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	USP53	Q70EK8	1073 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	GPR27	Q9NS67	375 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	CLDND1	Q9NY35	253 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	SNTG2	Q9NY99	539 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	SGSM2	O43147	1006 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	PRODH	O43272	600 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	TRIM13	O60858	407 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	CHRNA2	Q15822	529 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	NSMF	Q6X4W1	530 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	OSBP2	Q969R2	916 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	KCNC2	Q96PR1	638 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	PALD1	Q9ULE6	856 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	FFAR3	O14843	346 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	CYP2C8	P10632	490 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	HTRA3	P83110	453 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	SOGA3	Q5TF21	947 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	MIB1	Q86YT6	1006 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	DCAF4	Q8WV16	495 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	UBXN4	Q92575	508 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM6-215	ENST00000466247	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	BLACE	A4D250	179 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	ADCY3	O60266	1144 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	DGKI	O75912	1065 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	SASH1	O94885	1247 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	C8B	P07358	591 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	VWA3B	Q502W6	1294 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	SP8	Q8IXZ3	490 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	DNAJC7	Q99615	494 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	LNPK	Q9C0E8	428 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	MSC	O60682	206 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	FAM153B	P0C7A2	387 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	HOXA5	P20719	270 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	NTRK3	Q16288	839 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM6-215	ENST00000466247	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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