RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461405.1

PHF20-208, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 2

Gene PHF20, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-208	ENST00000461405	GNA11	P29992	359 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	SREBF1	P36956	1147 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	KRT40	Q6A162	431 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	MMP1	P03956	469 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	SMPD1	P17405	629 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	GJB2	P29033	226 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	CNGA1	P29973	690 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	CCND2	P30279	289 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	SOX10	P56693	466 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	STXBP2	Q15833	593 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	GJA8	P48165	433 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	NR5A1	Q13285	461 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405		B4DLN1	442 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	CTAGE5	O15320	804 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	MSC	O60682	206 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	SGPL1	O95470	568 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	XBP1	P17861	261 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	ITGB5	P18084	799 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	COPS5	Q92905	334 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	FAM86B1	E9PN63	330 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	STAM2	O75886	525 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	CYP3A4	P08684	503 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	ICAM3	P32942	547 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	KRT2	P35908	639 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	TBCK	Q8TEA7	893 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	LENG9	Q96B70	501 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PHF20-208	ENST00000461405	WNT7A	O00755	349 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PHF20-208	ENST00000461405	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PHF20-208	ENST00000461405	PGK1	P00558	417 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PHF20-208	ENST00000461405	RARB	P10826	455 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PHF20-208	ENST00000461405	NKX3-2	P78367	333 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PHF20-208	ENST00000461405	SP2	Q02086	613 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PHF20-208	ENST00000461405	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PHF20-208	ENST00000461405	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PHF20-208	ENST00000461405	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PHF20-208	ENST00000461405	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PHF20-208	ENST00000461405	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PHF20-208	ENST00000461405	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.83	□□□□□ -0.2

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