RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	USP17L8	P0C7I0	530 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	SRGN	P10124	158 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	CCNE1	P24864	410 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	FUT2	Q10981	343 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	PRPH	P41219	470 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	GUCY2D	Q02846	1103 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	TMC4	Q7Z404	712 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	MS4A14	Q96JA4	679 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	SH3GL2	Q99962	352 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	SNX12	Q9UMY4	172 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	MST1R	Q04912	1400 aa		12.52	□□□□□ -0.4
SSUH2-208	ENST00000455157	KRT14	P02533	472 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	CDR1	P51861	262 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	MTA1	Q13330	715 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRC41	Q15345	812 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	NFU1	Q9UMS0	254 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	ANO9	A1A5B4	782 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	USP17L3	A6NCW0	530 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	USP17L4	A6NCW7	530 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP2C2	O75185	946 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	PRDX5	P30044	214 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNB1	Q14721	858 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	NOX5	Q96PH1	765 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	FTCD	O95954	541 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM74	Q86UV6	250 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM73	Q86UV7	250 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	C3orf20	Q8ND61	904 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	TAF4B	Q92750	862 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	BATF3	Q9NR55	127 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	STIM2	Q9P246	746 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	C4A	P0C0L4	1744 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	C4B	P0C0L5	1744 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRC53	A6NM62	1247 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	ENO4	A6NNW6	628 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	EPHB4	P54760	987 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	MECOM	Q03112	1051 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	NPY5R	Q15761	445 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	TTI2	Q6NXR4	508 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	SV2B	Q7L1I2	683 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	RETREG2	Q8NC44	543 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	ARL8A	Q96BM9	186 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	KIF1A	Q12756	1690 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	HSPA2	P54652	639 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	NNT	Q13423	1086 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	E2F5	Q15329	346 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	ARMC3	Q5W041	872 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	TSG101	Q99816	390 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	NDST4	Q9H3R1	872 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	USP54	Q70EL1	1684 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	TRAF5	O00463	557 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SSUH2-208	ENST00000455157	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		12.5	□□□□□ -0.41

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