RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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CXCL16-201ENST00000293778 UIMC1Q96RL1 719 aa22.25■■□□□ 1.15
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CXCL16-201ENST00000293778 TSG101Q99816 390 aa22.23■■□□□ 1.15
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CXCL16-201ENST00000293778 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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CXCL16-201ENST00000293778 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CXCL16-201ENST00000293778 NDST4Q9H3R1 872 aa22.22■■□□□ 1.15
CXCL16-201ENST00000293778 PLA2G4BP0C869 781 aa22.21■■□□□ 1.15
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CXCL16-201ENST00000293778 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.21■■□□□ 1.15
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