RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 ECEL1O95672 775 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 SRLQ86TD4 932 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 OPHN1O60890 802 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 MESDQ14696 234 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 GJA10Q969M2 543 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 UIMC1Q96RL1 719 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 TNNI1P19237 187 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 SESN3P58005 492 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 BAG2O95816 211 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 BPIFB4P59827 614 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 FBXO41Q8TF61 875 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 PLAAQ9Y263 795 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA13-201ENST00000222753 MYO1FO00160 1098 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 MYL7Q01449 175 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 RASA3Q14644 834 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 TRIM11Q96F44 468 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 PLCG1P19174 1290 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 PSMD1Q99460 953 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 BFSP1Q12934 665 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 TAF11Q15544 211 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 WDR24Q96S15 920 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 H0YCG3 227 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 H7C1W4 665 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 CASC4Q6P4E1 433 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 TEKT1Q969V4 418 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 K7ENM7 598 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 SKIP12755 728 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 CDC25AP30304 524 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 DR1Q01658 176 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 MFAP3P55082 362 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 GDAQ9Y2T3 454 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 LRRC41Q15345 812 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 GEN1Q17RS7 908 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 LCORLQ8N3X6 602 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 TBCKQ8TEA7 893 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 CCT6BQ92526 530 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 EPC1Q9H2F5 836 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 A0A1W2PQC6 194 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 SGO2Q562F6 1265 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 PI16Q6UXB8 463 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 SCOCQ9UIL1 159 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 SRGAP2O75044 1071 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 PSMD6Q15008 389 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 NCAPD2Q15021 1401 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 CUL4BQ13620 913 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 HAUS1Q96CS2 278 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 GMNCA6NCL1 334 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 PRKAB2O43741 272 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA13-201ENST00000222753 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms