RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639844.1

RPS27A-211, Transcript of ribosomal protein S27a, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RPS27A, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27A-211ENST00000639844 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 RMDN3Q96TC7 470 aa22.17■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 COL20A1Q9P218 1284 aa22.17■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 LTBP2Q14767 1821 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 ARVCFO00192 962 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 KIAA0355O15063 1070 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 FAAP100Q0VG06 881 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 CALM1P0DP23 149 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 CALM2P0DP24 149 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 CALM3P0DP25 149 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 PTGS1P23219 599 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 PPP2R5BQ15173 497 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 STXBP2Q15833 593 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS27A-211ENST00000639844 GNAQP50148 359 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 CPT1AP50416 773 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 TTLL4Q14679 1199 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 BADQ92934 168 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 NEK1Q96PY6 1258 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 MYL10Q9BUA6 226 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 RAG1P15918 1043 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 PXMP2Q9NR77 195 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 LAMA3Q16787 3333 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 NR3C2P08235 984 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 ITGA7Q13683 1181 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 KRT32Q14532 448 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 TBX21Q9UL17 535 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 POLR2MP0CAP2 368 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 ITGB8P26012 769 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 RASEFQ8IZ41 740 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 SZT2Q5T011 3432 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 A6NJR5 290 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 KPNA6O60684 536 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 ARIH2O95376 493 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 CD4P01730 458 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 GPR153Q6NV75 609 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 LRCH3Q96II8 777 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 GRIN2DO15399 1336 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 TIMP1P01033 207 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 FANCBQ8NB91 859 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 COPS5Q92905 334 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 RXRAP19793 462 aa22.08■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 PGM5Q15124 567 aa22.08■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.08■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 KCNB2Q92953 911 aa22.08■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RPS27A-211ENST00000639844 GH1P01241 217 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 MYL3P08590 195 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 PSMC6P62333 389 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 FPGSQ05932 587 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 SHHQ15465 462 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 LY6KQ17RY6 165 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 MFSD5Q6N075 450 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 APOA5Q6Q788 366 aa22.07■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.06■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 REC8O95072 547 aa22.06■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 HSPA4P34932 840 aa22.06■■□□□ 1.12
RPS27A-211ENST00000639844 ARHGAP1Q07960 439 aa22.06■■□□□ 1.12
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