RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561868.1

SPNS1-205, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 441 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-205ENST00000561868 MAP3K14Q99558 947 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 LY9Q9HBG7 655 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 VTA1Q9NP79 307 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 PNMA2Q9UL42 364 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 CDH23Q9H251 3354 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 SOWAHBA6NEL2 793 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 BEX3Q00994 111 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 KRT32Q14532 448 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 USP26Q9BXU7 913 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 GBF1Q92538 1859 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 CYP2C18P33260 490 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 SNAP25P60880 206 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 CXCL17Q6UXB2 119 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 STAG2Q8N3U4 1231 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 CYP39A1Q9NYL5 469 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 ASTN1O14525 1302 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 VCANP13611 3396 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 PFKMP08237 780 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 ACRP10323 421 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 GRM4Q14833 912 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 ADGRF4Q8IZF3 695 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 MORC4Q8TE76 937 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 SLC28A3Q9HAS3 691 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 POLR3EQ9NVU0 708 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 THEGQ9P2T0 379 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 CCPG1Q9ULG6 757 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 NCOR1O75376 2440 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 KLRF2D3W0D1 207 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 TNFRSF10AO00220 468 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 SMPD1P17405 629 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 PBX2P40425 430 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 CATIPQ7Z7H3 387 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 USP38Q8NB14 1042 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 MTMR8Q96EF0 704 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 CPVLQ9H3G5 476 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 JMJD4Q9H9V9 463 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS1-205ENST00000561868 LCTP09848 1927 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 GRXCR1A8MXD5 290 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 TAPT1Q6NXT6 567 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 NSMFQ6X4W1 530 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 FBXL16Q8N461 479 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 MAF1Q9H063 256 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 RIOX1Q9H6W3 641 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 DDAH1O94760 285 aa18.19■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 SMARCA1P28370 1054 aa18.19■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 CPT1AP50416 773 aa18.19■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 SLC35G1Q2M3R5 365 aa18.19■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 MUM1L1Q5H9M0 696 aa18.19■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 ZNF654Q8IZM8 581 aa18.19■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 IL27Q8NEV9 243 aa18.19■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 CLEC4DQ8WXI8 215 aa18.19■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa18.19■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 B4DLN1 442 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 CYTH3O43739 400 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 B4GALT4O60513 344 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 RGS22Q8NE09 1264 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 GRIN2DO15399 1336 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 KPNA6O60684 536 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 CCL23P55773 120 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 QRICH1Q2TAL8 776 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 EEPD1Q7L9B9 569 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 OTOP2Q7RTS6 562 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 ASB2Q96Q27 587 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 PDGFCQ9NRA1 345 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-205ENST00000561868 CCDC69A6NI79 296 aa18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80 ms