RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 IQCEQ6IPM2 695 aa5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 LIPIQ6XZB0 460 aa5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 CLEC1BQ9P126 229 aa5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.53□□□□□ -1.52
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 FUCA1P04066 466 aa5.52□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 THBDP07204 575 aa5.52□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 MC3RP41968 323 aa5.52□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.52□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SYT8Q8NBV8 401 aa5.52□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.52□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 AP5M1Q9H0R1 490 aa5.52□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 RXFP1Q9HBX9 757 aa5.52□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 NTRK1P04629 796 aa5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 CELA3BP08861 270 aa5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 HOXC12P31275 282 aa5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 GTF2A2P52657 109 aa5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 NPLOC4Q8TAT6 608 aa5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 MARCH2Q9P0N8 246 aa5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 PRKAG3Q9UGI9 489 aa5.51□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SLC6A11P48066 632 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 KCNAB2Q13303 367 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 MROH9Q5TGP6 573 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 MBLAC2Q68D91 279 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 RIOX2Q8IUF8 465 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 FAM178BQ8IXR5 827 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 Q8N1Y9 231 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SEC14L1Q92503 715 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 CCDC140Q96MF4 163 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 NTMQ9P121 344 aa5.5□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 MYO1BO43795 1136 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SUSD5O60279 629 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 CPP00450 1065 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SCG5P05408 212 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 CYP2C8P10632 490 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 FXNQ16595 210 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 ZNF227Q86WZ6 799 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 CARFQ8N187 725 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 FRS2Q8WU20 508 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 DPF3Q92784 378 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 DIO2Q92813 273 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SPATA25Q9BR10 227 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 BCAS3Q9H6U6 928 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 USP40Q9NVE5 1235 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5.49□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 C22orf46C9J442 243 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 TCF3P15923 654 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 TESK1Q15569 626 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 INF2Q27J81 1249 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 SV2CQ496J9 727 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 MIB1Q86YT6 1006 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 BTN2A2Q8WVV5 523 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 EPN3Q9H201 632 aa5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 A0A1B0GTL3 188 aa5.47□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 DDAH1O94760 285 aa5.47□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 ITGAVP06756 1048 aa5.47□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 GJA9P57773 515 aa5.47□□□□□ -1.53
RRN3-204ENST00000561685 CYP4F3Q08477 520 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 160 ms