RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC103Q8IW40 242 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PJA1Q8NG27 643 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC5A5Q92911 643 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 E2F7Q96AV8 911 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MKS1Q9NXB0 559 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLEC1BQ9P126 229 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC66A2RUB6 948 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OIP5O43482 229 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT37O76014 449 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL33O95760 270 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CFBP00751 764 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LTFP02788 710 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLS3P13797 630 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFNGR1P15260 489 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP7A1P22680 504 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LTBRP36941 435 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTSKP43235 329 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP11P51784 963 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST5P78524 1137 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDB1Q16531 1140 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RGL3Q3MIN7 710 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM240Q5SV17 173 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PODNQ7Z5L7 613 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TICAM2Q86XR7 235 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXO41Q8TF61 875 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DIO2Q92813 273 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPCSQ9HAB8 311 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OXSMQ9NWU1 459 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APAF1O14727 1248 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSNP06396 782 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NFICP08651 508 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBP3P10745 1247 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PREPP48147 710 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEPHS1P49903 392 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCAND1P57086 179 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GTF2H3Q13889 308 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MORC3Q14149 939 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BROXQ5VW32 411 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KSR1Q8IVT5 923 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CMIPQ8IY22 773 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IPPKQ9H8X2 491 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERC2O15083 957 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHGA12O60330 932 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CBX7O95931 251 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNAB2Q13303 367 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDK5R2Q13319 367 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GBX1Q14549 363 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIZQ2M2Z5 673 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXW5Q969U6 566 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q96M66 194 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATG3Q9NT62 314 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PNMA2Q9UL42 364 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.26□□□□□ -1.41
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