RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L19D6RCP7 530 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L20D6RJB6 530 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 WNT10BO00744 389 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MEIS2O14770 477 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 EGFRP00533 1210 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ECE1P42892 770 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 USP11P51784 963 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K10Q02779 954 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L24Q0WX57 530 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PAK1Q13153 545 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MCTP2Q6DN12 878 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO11Q86XK2 927 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PLIN2Q99541 437 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ANO3Q9BYT9 981 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PRCPP42785 496 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 KCNJ6P48051 423 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 NR1I3Q14994 352 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 HAS1Q92839 578 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM9Q9C026 710 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GOPCQ9HD26 462 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 STK17AQ9UEE5 414 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GDAQ9Y2T3 454 aa9.21□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 NRDCO43847 1150 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CYP3A7P24462 503 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 STAT2P52630 851 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 AMPD3Q01432 767 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 GRB10Q13322 594 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 ADSSL1Q8N142 457 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 ACER1Q8TDN7 264 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 MBOAT7Q96N66 472 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PNMA5Q96PV4 448 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 POTEMA6NI47 508 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 TPM2P07951 284 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CAP2P40123 477 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 NELFBQ8WX92 580 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 TMX1Q9H3N1 280 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PLA2G6O60733 806 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 SNAP25P60880 206 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 SPAG1Q07617 926 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 TRAF1Q13077 416 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 USH1GQ495M9 461 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 KRT79Q5XKE5 535 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC112Q8NEF3 446 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 SH2D4AQ9H788 454 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 VCPKMTQ9H867 229 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 OPLAHO14841 1288 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PBX1P40424 430 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 STIM1Q13586 685 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 SV2BQ7L1I2 683 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 USP27XA6NNY8 438 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 PIK3CDO00329 1044 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 SLC26A4O43511 780 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 ASNSP08243 561 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 POTEIP0CG38 1075 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-208ENST00000502484 POTEJP0CG39 1038 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms