RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.02■■□□□ 1.12
NISCH-209ENST00000485765 PXMP2Q9NR77 195 aa22.02■■□□□ 1.12
NISCH-209ENST00000485765 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NISCH-209ENST00000485765 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.02■■□□□ 1.12
NISCH-209ENST00000485765 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 A0A1W2PQY0 241 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 POLR2MP0CAP2 368 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 PPP2R5BQ15173 497 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 GNASQ5JWF2 1037 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 EVCP57679 992 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 STXBP2Q15833 593 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 RTN1Q16799 776 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 RUFY3Q7L099 469 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 TLK2Q86UE8 772 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 CEP290O15078 2479 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 ASGR1P07306 291 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 NR3C2P08235 984 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 PTGS1P23219 599 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 CDC27P30260 824 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 RTP1P59025 263 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 APOBRQ0VD83 1088 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 SCFD2Q8WU76 684 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 BRF1Q92994 677 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 PRO3102Q9H379 93 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 PIK3CDO00329 1044 aa21.98■■□□□ 1.11
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NISCH-209ENST00000485765 FGD1P98174 961 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 ELP1O95163 1332 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 MEIS2O14770 477 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 BEX3Q00994 111 aa21.97■■□□□ 1.11
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NISCH-209ENST00000485765 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 NID2Q14112 1375 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 ARIH2O95376 493 aa21.96■■□□□ 1.11
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NISCH-209ENST00000485765 TTLL4Q14679 1199 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 PGM5Q15124 567 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 TRIM60Q495X7 471 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.96■■□□□ 1.11
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NISCH-209ENST00000485765 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-209ENST00000485765 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.95■■□□□ 1.1
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NISCH-209ENST00000485765 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
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NISCH-209ENST00000485765 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.95■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 IL17RAQ96F46 866 aa21.95■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 GDF15Q99988 308 aa21.95■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 ZEB2O60315 1214 aa21.94■■□□□ 1.1
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NISCH-209ENST00000485765 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.94■■□□□ 1.1
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NISCH-209ENST00000485765 COPS5Q92905 334 aa21.94■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 TOX2Q96NM4 488 aa21.94■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.94■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.93■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.93■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 IL31RAQ8NI17 732 aa21.93■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 CUL5Q93034 780 aa21.93■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 A6NJR5 290 aa21.92■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NISCH-209ENST00000485765 BMP8BP34820 402 aa21.92■■□□□ 1.1
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