RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 DDAH1O94760 285 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 COPB2P35606 906 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 CD151P48509 253 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 KRT32Q14532 448 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 MORN1Q5T089 497 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ELP3Q9H9T3 547 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 PNMA2Q9UL42 364 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 GH2P01242 217 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 VCAM1P19320 739 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ELF1P32519 619 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 DSG3P32926 999 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 GSDMDP57764 484 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 CAMK4Q16566 473 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 SLURP2P0DP57 97 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 CAP1Q01518 475 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 TROAPQ12815 778 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 IQCB1Q15051 598 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 PPP2R5BQ15173 497 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 CEP95Q96GE4 821 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 CLSTN2Q9H4D0 955 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 MTMR6Q9Y217 621 aa8.64□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 MAP2K7O14733 419 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 AOC2O75106 756 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 GRM4Q14833 912 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 TREML2Q5T2D2 321 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 USP17L15C9J2P7 530 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 USP17L11C9JVI0 530 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 USP17L18D6R9N7 530 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 USP17L22D6RA61 530 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 USP17L19D6RCP7 530 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 USP17L20D6RJB6 530 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 USP17L24Q0WX57 530 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 TKFCQ3LXA3 575 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 RILPL2Q969X0 211 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 FEM1BQ9UK73 627 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ZNF213O14771 459 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 CTGFP29279 349 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 SEPT2Q15019 361 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ESR2Q92731 530 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 PDHBP11177 359 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 SCRN1Q12765 414 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 PSMD2Q13200 908 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 FAM160B2Q86V87 743 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 RASEFQ8IZ41 740 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 GOPCQ9HD26 462 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 DACT1Q9NYF0 836 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 DNAI1Q9UI46 699 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 GJD2Q9UKL4 321 aa8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
USP4-211ENST00000485450 FZD1Q9UP38 647 aa8.62□□□□□ -1.03
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