RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CACNB3P54284 484 aa18.2■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB17Q9H0T7 212 aa18.18■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MLXIPQ9HAP2 919 aa18.18■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BBOX1O75936 387 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPREP23469 700 aa18.16■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MESDQ14696 234 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC160A6NGH7 325 aa18.16■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTAGE3PQ8IX95 158 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POMGNT1Q8WZA1 660 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FTCDO95954 541 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KMT5BQ4FZB7 885 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CUEDC2Q9H467 287 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCIF1Q9H4Z3 704 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KANSL2Q9H9L4 492 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAD1O00515 517 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT31Q15323 416 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SWAP70Q9UH65 585 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.15■□□□□ 0.5
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