RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-215ENST00000480416 NCOR1O75376 2440 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 A0A0G2JMZ2 1700 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 A6NJR5 290 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 TGFBR3LH3BV60 316 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 CNMDO75829 334 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 TIMP1P01033 207 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 IGHA2P01877 340 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 PPP2R1AP30153 589 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 RGS2P41220 211 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 ID4P47928 161 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 CASP7P55210 303 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 RIPK4P57078 832 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 JAG1P78504 1218 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 CCINQ13939 588 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 PLEKHH3Q7Z736 793 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 TEKT1Q969V4 418 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 MDFIQ99750 246 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 KCNH6Q9H252 994 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 PICK1Q9NRD5 415 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 HYPKQ9NX55 129 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 HCN2Q9UL51 889 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 COG5Q9UP83 839 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 MYH3P11055 1940 aa4.13□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 PLXNA3P51805 1871 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 KBTBD13C9JR72 458 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 CHL1O00533 1208 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 DCXO43602 365 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 LPXNO60711 386 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 PGK1P00558 417 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 ALBP02768 609 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 CYBAP13498 195 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 ALADP13716 330 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 HERVK_113P62684 666 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 ERVK-24P63145 666 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 ATP2B2Q01814 1243 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 DOC2BQ14184 412 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 FAM47AQ5JRC9 791 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 FKBP1CQ5VVH2 108 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 MFSD14CQ5VZR4 134 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 MFSD5Q6N075 450 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 ANKMY2Q8IV38 441 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 ARRDC4Q8NCT1 418 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 ZNF280CQ8ND82 737 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 VWCEQ96DN2 955 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 HOOK2Q96ED9 719 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 CFAP53Q96M91 514 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 APBA2Q99767 749 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 PAGR1Q9BTK6 254 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 MRIQ9BWK5 157 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 IGFLR1Q9H665 355 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP40Q9NVE5 1235 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 SLC6A14Q9UN76 642 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 UMODL1Q5DID0 1318 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 SMCHD1A6NHR9 2005 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa4.12□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 A0A1W2PQY0 241 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 PI4KAP2A4QPH2 592 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP17L15C9J2P7 530 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP17L10C9JJH3 530 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP17L13C9JLJ4 530 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP17L12C9JPN9 530 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP17L11C9JVI0 530 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP17L21D6R901 530 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP17L18D6R9N7 530 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP17L22D6RA61 530 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP17L17D6RBQ6 530 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP17L19D6RCP7 530 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 USP17L20D6RJB6 530 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 H0Y858 1186 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 FGBP02675 491 aa4.11□□□□□ -1.75
TNS1-215ENST00000480416 CA3P07451 260 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms