RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	C1QL4	Q86Z23	238 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	DIO2	Q92813	273 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	MMP19	Q99542	508 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	KCNK12	Q9HB15	430 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	FANCL	Q9NW38	375 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM260	Q9NX78	707 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM253	P0C7T8	217 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	MED14OS	P0DP75	135 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	LCP1	P13796	627 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	PRKCA	P17252	672 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	LTBR	P36941	435 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	IQCE	Q6IPM2	695 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	NUP43	Q8NFH3	380 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	CD320	Q9NPF0	282 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RBM39-231	ENST00000477334	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	NPHS1	O60500	1241 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	MSL3P1	P0C860	447 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	GLDC	P23378	1020 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	KCNAB2	Q13303	367 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	HOMER1	Q86YM7	354 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	DCAF4	Q8WV16	495 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	APPBP2	Q92624	585 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	BTG4	Q9NY30	223 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	GULP1	Q9UBP9	304 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	ASXL2	Q76L83	1435 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	MSC	O60682	206 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	CDC45	O75419	566 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	ASMTL	O95671	621 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	TACR1	P25103	407 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	MVK	Q03426	396 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	SDE2	Q6IQ49	451 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	NLRX1	Q86UT6	975 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	DPF3	Q92784	378 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	RAPGEF3	O95398	923 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	CYP4F8	P98187	520 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	SNX17	Q15036	470 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	TESK1	Q15569	626 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	KCNA10	Q16322	511 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	TKFC	Q3LXA3	575 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	STYK1	Q6J9G0	422 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	PTPRN2	Q92932	1015 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	SHISA4	Q96DD7	197 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	GPR27	Q9NS67	375 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334		A0A1W2PQJ5	194 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	MYO1B	O43795	1136 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	FUCA1	P04066	466 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	SDHB	P21912	280 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	BCL6	P41182	706 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	GABRE	P78334	506 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	USP33	Q8TEY7	942 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	KCNN1	Q92952	543 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBM39-231	ENST00000477334	ENPP3	O14638	875 aa		6.23	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.9 ms