RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439806.6

CPNE1-218, Transcript of copine 1, humanhuman

TSL 5

Gene CPNE1, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1-218ENST00000439806 A0A1W2PQC6 194 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 SLC26A4O43511 780 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 DNM2P50570 870 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 AP3B2Q13367 1082 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 MTF1Q14872 753 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 ELF2Q15723 593 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 SLC15A2Q16348 729 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 TMEM119Q4V9L6 283 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 CCDC93Q567U6 631 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 V9GYY5 206 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 MYMKA6NI61 221 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 FCER1AP12319 257 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 IDEP14735 1019 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 FECHP22830 423 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 KRT9P35527 623 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 STK4Q13043 487 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 PSMD2Q13200 908 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 DYMQ7RTS9 669 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 FBXO11Q86XK2 927 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 IRF2BP1Q8IU81 584 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 TSG101Q99816 390 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 NUP58Q9BVL2 599 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 AMNQ9BXJ7 453 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.65□□□□□ -0.54
CPNE1-218ENST00000439806 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.65□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 B4DLN1 442 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 F5H6K3 240 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 EDIL3O43854 480 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 KIF5CO60282 957 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 USP11P51784 963 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 KLRC3Q07444 240 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 MOXD1Q6UVY6 613 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 GMCL1Q96IK5 515 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.559e-8■■■■■ 116.8
CPNE1-218ENST00000439806 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 PCDHA12Q9UN75 941 aa11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 YDJCA8MPS7 323 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 USP17L15C9J2P7 530 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 USP17L11C9JVI0 530 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 USP17L18D6R9N7 530 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 USP17L22D6RA61 530 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 USP17L19D6RCP7 530 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 USP17L20D6RJB6 530 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 C21orf2O43822 256 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 NDUFB10O96000 172 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 GH2P01242 217 aa11.63□□□□□ -0.55
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CPNE1-218ENST00000439806 ERVK-24P63145 666 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 USP17L24Q0WX57 530 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 ERMNQ8TAM6 284 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 UBXN4Q92575 508 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 HAS1Q92839 578 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 WDR24Q96S15 920 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 CSRNP1Q96S65 589 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CPNE1-218ENST00000439806 CARD6Q9BX69 1037 aa11.63□□□□□ -0.55
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