RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.9■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 SCFD2Q8WU76 684 aa22.9■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LTB-210ENST00000429299 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.89■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 PPP2R5BQ15173 497 aa22.89■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 DCAF4Q8WV16 495 aa22.89■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.89■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 PNMA2Q9UL42 364 aa22.89■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 NFIBO00712 420 aa22.88■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 NMT2O60551 498 aa22.88■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 NOVP48745 357 aa22.88■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 PDE4DQ08499 809 aa22.88■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.88■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 LCTP09848 1927 aa22.88■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 CCDC96Q2M329 555 aa22.87■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.87■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 CAGE1Q8TC20 777 aa22.87■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.87■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.87■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 MTMR7Q9Y216 660 aa22.87■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 B4DLN1 442 aa22.86■■□□□ 1.25
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LTB-210ENST00000429299 EDNRBP24530 442 aa22.86■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 CALML3P27482 149 aa22.86■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 SLC16A2P36021 539 aa22.86■■□□□ 1.25
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LTB-210ENST00000429299 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.86■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.86■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.86■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 DNERQ8NFT8 737 aa22.86■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.86■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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LTB-210ENST00000429299 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.85■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.85■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 SPRED2Q7Z698 418 aa22.85■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.85■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 CD320Q9NPF0 282 aa22.85■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 INCENPQ9NQS7 918 aa22.85■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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LTB-210ENST00000429299 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.84■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.84■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 GPNMBQ14956 572 aa22.84■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.84■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 SESTD1Q86VW0 696 aa22.84■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 COPS5Q92905 334 aa22.84■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 RAD9AQ99638 391 aa22.84■■□□□ 1.25
LTB-210ENST00000429299 SELPP16109 830 aa22.83■■□□□ 1.25
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LTB-210ENST00000429299 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.82■■□□□ 1.24
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LTB-210ENST00000429299 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.81■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.81■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 GJD3Q8N144 294 aa22.81■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 FSD1Q9BTV5 496 aa22.81■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.81■■□□□ 1.24
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LTB-210ENST00000429299 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.8■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 RGS22Q8NE09 1264 aa22.8■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.8■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.8■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 ARIH2O95376 493 aa22.79■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 IGHDP01880 384 aa22.79■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 IKBKEQ14164 716 aa22.79■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 AFG1LQ8WV93 481 aa22.79■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.79■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.79■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 LINC01553A4QN01 128 aa22.78■■□□□ 1.24
LTB-210ENST00000429299 NBNO60934 754 aa22.78■■□□□ 1.24
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