RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 IL13P35225 146 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 RINT1Q6NUQ1 792 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 SAAL1Q96ER3 474 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 KCND1Q9NSA2 647 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ADGRB3O60242 1522 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ITIH6Q6UXX5 1313 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MTA1Q13330 715 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 OLFML2BQ68BL8 750 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 UIMC1Q96RL1 719 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 PICK1Q9NRD5 415 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 RWDD2AQ9UIY3 292 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 AGLP35573 1532 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 PFKFB2O60825 505 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF202O95125 648 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ATP5JP18859 108 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 GCKP35557 465 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ASIC1P78348 528 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TADA2BQ86TJ2 420 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MYH13Q9UKX3 1938 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MEIS1O00470 390 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 KRT8P05787 483 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MYBL1P10243 752 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MED21Q13503 144 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 PAF1Q8N7H5 531 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC63Q8NA47 563 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 BANK1Q8NDB2 785 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 IFT81Q8WYA0 676 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MYH1P12882 1939 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 MYH4Q9Y623 1939 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 EYA2O00167 538 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 BASP1P80723 227 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 RIN3Q8TB24 985 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 NRKQ7Z2Y5 1582 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 EFCAB14O75071 495 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 HOXC6P09630 235 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 PHKG2P15735 406 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 SLC39A6Q13433 755 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM60Q495X7 471 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 PEX26Q7Z412 305 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGEF9O43307 516 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 TOMM70O94826 608 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZUG5 572 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRD-201ENST00000355233 MAP7D3Q8IWC1 876 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 OLFML3Q9NRN5 406 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 AP3M1Q9Y2T2 418 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC160A6NGH7 325 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 ATP2B1P20020 1258 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRD-201ENST00000355233 STX2P32856 288 aa5.34□□□□□ -1.55
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