RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 ANKRD40Q6AI12 368 aa19.47■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 TPH2Q8IWU9 490 aa19.47■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa19.47■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 ASIC3Q9UHC3 531 aa19.47■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa19.47■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 CCNE1P24864 410 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 CRKLP46109 303 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 TMTC3Q6ZXV5 915 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 KCTD1Q719H9 257 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 DPH6Q7L8W6 267 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 MYCT1Q8N699 235 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 FBF1Q8TES7 1133 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 PCDHA4Q9UN74 947 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 NR1D1P20393 614 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 A0A087X0B3 334 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 HARSP12081 509 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 ERMNQ8TAM6 284 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 LRRC27Q9C0I9 530 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 STIM2Q9P246 746 aa19.46■□□□□ 0.71
NOMO3-201ENST00000263012 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 TRIM68Q6AZZ1 485 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 EFCAB13Q8IY85 973 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 LRRC45Q96CN5 670 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM60Q9H2L4 133 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 GOLGA8KD6RF30 607 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 SORBS3O60504 671 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 SLC1A4P43007 532 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 EPHB4P54760 987 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 SGMS1Q86VZ5 419 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 MAP3K14Q99558 947 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 USTQ9Y2C2 406 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 CALCOCO2Q13137 446 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 RASGRP2Q7LDG7 609 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 SPATA4Q8NEY3 305 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 LMBR1Q8WVP7 490 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 NEBLO76041 1014 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 CFBP00751 764 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 HLA-DOAP06340 250 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 NR2F2P24468 414 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 PPP2R5BQ15173 497 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC6Q16204 474 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 HDAC7Q8WUI4 952 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 BICD1Q96G01 975 aa19.45■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 ARHGAP25P42331 645 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 GTF2IP78347 998 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 SPICE1Q8N0Z3 855 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 FAM212AQ96EL1 285 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 L1RE1Q9UN81 338 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 PALLDQ8WX93 1383 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 EPB41P11171 864 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 MFSD14BQ5SR56 506 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 OSBPL9Q96SU4 736 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 TBK1Q9UHD2 729 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 HPSEQ9Y251 543 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 STAG1Q8WVM7 1258 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 PLAAQ9Y263 795 aa19.44■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 GFPT2O94808 682 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 KRT5P13647 590 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 GSTO1P78417 241 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 ATG3Q9NT62 314 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 CEP83Q9Y592 693 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 FAM196BA6NMK8 535 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 EXOC3O60645 756 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 DPYDQ12882 1025 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 RUFY4Q6ZNE9 571 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF804AQ7Z570 1209 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 ADAM33Q9BZ11 813 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 ZBTB16Q05516 673 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 SNX1Q13596 522 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 RETREG2Q8NC44 543 aa19.43■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 PTPRUQ92729 1446 aa19.42■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 FLOT1O75955 427 aa19.42■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 CARSP49589 748 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 ISCA1Q9BUE6 129 aa19.42■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
NOMO3-201ENST00000263012 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms