RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 VGLL4Q14135 290 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 LDHDQ86WU2 507 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 AK8Q96MA6 479 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 PARP14Q460N5 1801 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-207ENST00000589146 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 OTOFQ9HC10 1997 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 NF2P35240 595 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 GHRHRQ02643 423 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 DLK2Q6UY11 383 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CNNM3Q8NE01 707 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SREBF1P36956 1147 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 DGKZQ13574 1117 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 STX1AQ16623 288 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CSADQ9Y600 493 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 RLFQ13129 1914 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A087X0B3 334 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 FLOT1O75955 427 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 TDP2O95551 362 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SERTAD1Q9UHV2 236 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC37A4O43826 429 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBED4O75132 1171 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP3A4P08684 503 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SLFN14P0C7P3 912 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR2MP0CAP2 368 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CIITAP33076 1130 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.725e-6■■□□□ 12.9
CAPNS1-207ENST00000589146 HMGCS2P54868 508 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKG1Q13976 671 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 E2F4Q16254 413 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CALCRLQ16602 461 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 POTEDQ86YR6 584 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 ANO10Q9NW15 660 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 MYPNQ86TC9 1320 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 TXLNAP40222 546 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP4P98171 946 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 DSG3P32926 999 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 HSD17B4P51659 736 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 OAZ1P54368 228 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 PPATQ06203 517 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 PDIA5Q14554 519 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 IQUBQ8NA54 791 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF214Q8ND24 703 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-207ENST00000589146 VWA5AO00534 786 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRP12P59046 1061 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 POSTNQ15063 836 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 Q4G0T1 1027 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 NT5DC1Q5TFE4 455 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PDILTQ8N807 584 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 REPS2Q8NFH8 660 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX58Q96C10 678 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PANK2Q9BZ23 570 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 COG2Q14746 738 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ERO1BQ86YB8 467 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D5Q92609 795 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 HAS1Q92839 578 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 MAF1Q9H063 256 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRFP10586 1907 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 UNCXA6NJT0 531 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CXCL11O14625 94 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP2A1O14983 1001 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 TBX3O15119 743 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 UBA7P41226 1012 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 SARSP49591 514 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PNOCQ13519 176 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.74■■□□□ 1.71
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