RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 BMP6P22004 513 aa32.16■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-210ENST00000574322 USP11P51784 963 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-210ENST00000574322 DPYDQ12882 1025 aa32.15■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IGSF22Q8N9C0 903 aa32.15■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-210ENST00000574322 USP17L18D6R9N7 530 aa32.13■■■□□ 2.73
CTDNEP1-210ENST00000574322 USP17L22D6RA61 530 aa32.13■■■□□ 2.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KBTBD4Q9NVX7 518 aa32.07■■■□□ 2.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 SREBF1P36956 1147 aa32.06■■■□□ 2.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 TXKP42681 527 aa32.06■■■□□ 2.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
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