RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-222ENST00000567147 PNMA1Q8ND90 353 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 KAT14Q9H8E8 782 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 REV3LO60673 3130 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 ADCY6O43306 1168 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 IGFBP4P22692 258 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 ADGRE1Q14246 886 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 ZNF365Q70YC5 407 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 ASB2Q96Q27 587 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 THEGQ9P2T0 379 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 TNKSO95271 1327 aa20.48■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 SGSM2O43147 1006 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 CPVLQ9H3G5 476 aa20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 ASB14A6NK59 587 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 ASGR1P07306 291 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 CYP21A2P08686 494 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 CDK7P50613 346 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 KATNBL1Q9H079 304 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 PNMA2Q9UL42 364 aa20.46■□□□□ 0.87
RNPS1-222ENST00000567147 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 NFIBO00712 420 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 CYP2C18P33260 490 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 TRDNQ13061 729 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 RASIP1Q5U651 963 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 TMEM199Q8N511 208 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 ASTN1O14525 1302 aa20.45■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 MAP4K1Q92918 833 aa20.44■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 ELP1O95163 1332 aa20.44■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.44■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 ARVCFO00192 962 aa20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 SEC23AQ15436 765 aa20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 GNASQ5JWF2 1037 aa20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 MSRAQ9UJ68 235 aa20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.43■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 BEX3Q00994 111 aa20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 TNFAIP2Q03169 654 aa20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 SKAP1Q86WV1 359 aa20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.42■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 E7EWF7 191 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 CALML3P27482 149 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 GJA9P57773 515 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 USH1GQ495M9 461 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 IL27Q8NEV9 243 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 SPC25Q9HBM1 224 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.41■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 PTGS1P23219 599 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 RABGGTBP53611 331 aa20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-222ENST00000567147 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms