RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532872.5

RPS3-218, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-218ENST00000532872 TIMP1P01033 207 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 CALML3P27482 149 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 TNKSO95271 1327 aa15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 TLR3O15455 904 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 EPHB4P54760 987 aa15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 DUSP28Q4G0W2 176 aa15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 ASPRV1Q53RT3 343 aa15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 ZNF697Q5TEC3 545 aa15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 DNERQ8NFT8 737 aa15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 UBAC1Q9BSL1 405 aa15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 UBA5Q9GZZ9 404 aa15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 IL25Q9H293 177 aa15□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 PTGS1P23219 599 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 USH1GQ495M9 461 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 MFSD5Q6N075 450 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 RGS22Q8NE09 1264 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 MAF1Q9H063 256 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 CPVLQ9H3G5 476 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 B4DLN1 442 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 CD4P01730 458 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 EDNRBP24530 442 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 PDE4DQ08499 809 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 ITGA7Q13683 1181 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 ABCB11O95342 1321 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 TMEM199Q8N511 208 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 FAM161BQ96MY7 647 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 GUCD1Q96NT3 240 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 GRIN2DO15399 1336 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 CHMLP26374 656 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 CPT1AP50416 773 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 TRDNQ13061 729 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 PPP2R5BQ15173 497 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 SCFD2Q8WU76 684 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS3-218ENST00000532872 CSF2RAP15509 400 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 PSMC6P62333 389 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 SEC23AQ15436 765 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 FBXO11Q86XK2 927 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.022e-10■■■■□ 25.1
RPS3-218ENST00000532872 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 HIPK3Q9H422 1215 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 MYH6P13533 1939 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 B4GALT4O60513 344 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 CYP21A2P08686 494 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 CYP2C18P33260 490 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 PTH1RQ03431 593 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 TTLL4Q14679 1199 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 TMEM240Q5SV17 173 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 TBC1D5Q92609 795 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 KLRF2D3W0D1 207 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 SGSM2O43147 1006 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 MYL3P08590 195 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS3-218ENST00000532872 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms