RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521993.2

ERLIN2-209, Transcript of ER lipid raft associated 2, human

TSL 3

Gene ERLIN2, Length 764 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERLIN2-209	ENST00000521993	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PIEZO1	Q92508	2521 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	CHGB	P05060	677 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	STAT2	P52630	851 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	RETREG2	Q8NC44	543 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	CEP95	Q96GE4	821 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	CERS4	Q9HA82	394 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	VTA1	Q9NP79	307 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZNF536	O15090	1300 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TNKS	O95271	1327 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	HIP1	O00291	1037 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	CYP2C9	P11712	490 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	MCC	P23508	829 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TAP1	Q03518	808 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	GMCL1	Q96IK5	515 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	EPOP	A6NHQ4	379 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PLA2G6	O60733	806 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	ALAS1	P13196	640 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	GNAT2	P19087	354 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	SLC1A4	P43007	532 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	CPT1A	P50416	773 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	GRB10	Q13322	594 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	KRT40	Q6A162	431 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	MCM3AP	O60318	1980 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	GBF1	Q92538	1859 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	KPNA6	O60684	536 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PRDM1	O75626	825 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	BAIAP3	O94812	1187 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	APP	P05067	770 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	MYL3	P08590	195 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	IQCF3	P0C7M6	154 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PTGS1	P23219	599 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TDO2	P48775	406 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	SDS	P20132	328 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	KCNJ6	P48051	423 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	PDE4B	Q07343	736 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	BFSP2	Q13515	415 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	NSMF	Q6X4W1	530 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	APPBP2	Q92624	585 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ERLIN2-209	ENST00000521993	RAD50	Q92878	1312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ERLIN2-209	ENST00000521993	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ERLIN2-209	ENST00000521993	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms