RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	CABYR	O75952	493 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	CFB	P00751	764 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246		Q9Y3F1	56 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	MYH6	P13533	1939 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	CPT1A	P50416	773 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	ACLY	P53396	1101 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	GJA9	P57773	515 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	RTP1	P59025	263 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	STXBP2	Q15833	593 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	RMDN3	Q96TC7	470 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	BRCA2	P51587	3418 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PPC1	479 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	TROAP	Q12815	778 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNA10	Q16322	511 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	ELP1	O95163	1332 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PQY0	241 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	KPNA6	O60684	536 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SYN1	P17600	705 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	PIGS	Q96S52	555 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB43	O43298	467 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	ASGR1	P07306	291 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	ANTXR2	P58335	489 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	FGD4	Q96M96	766 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	CLTB	P09497	229 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	SMPD1	P17405	629 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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