RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 USP54Q70EL1 1684 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 USP8P40818 1118 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 CYP4A11Q02928 519 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 H0YCG3 227 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 STXBP2Q15833 593 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D5Q92609 795 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 STK17AQ9UEE5 414 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 GCNT3O95395 438 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 FCER1AP12319 257 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 NACC1Q96RE7 527 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 GINS2Q9Y248 185 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 RHBDL3P58872 404 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 CEP135Q66GS9 1140 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 DEPTORQ8TB45 409 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 TIGD1Q96MW7 591 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 FAM20AQ96MK3 541 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 MAP7D2Q96T17 732 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 COL18A1P39060 1754 aa9.21□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 USP11P51784 963 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF445P59923 1031 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 PNOCQ13519 176 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 FNBP1Q96RU3 617 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRD-211ENST00000486161 MYL1P05976 194 aa9.21□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 FAM212AQ96EL1 285 aa9.21□□□□□ -0.93
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PTPRD-211ENST00000486161 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 EEPD1Q7L9B9 569 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 LUZP1Q86V48 1076 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 OXER1Q8TDS5 423 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 SENP2Q9HC62 589 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 TMX2Q9Y320 296 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 SORBS3O60504 671 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRD-211ENST00000486161 PSAPP07602 524 aa9.21□□□□□ -0.94
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