RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 DNM1LO00429 736 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 KATNBL1Q9H079 304 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 CEP290O15078 2479 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB43O43298 467 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 RPS6KB1P23443 525 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 SMARCA1P28370 1054 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 FANCBQ8NB91 859 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 DNERQ8NFT8 737 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 KBTBD13C9JR72 458 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 Q6ZUG5 572 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 DPF3Q92784 378 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 CFBP00751 764 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 COL6A1P12109 1028 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 MORC4Q8TE76 937 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D5Q92609 795 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 RTN1Q16799 776 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 BRF1Q92994 677 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 VTA1Q9NP79 307 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-208ENST00000481121 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 B4DLN1 442 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 OPLAHO14841 1288 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 LRRC41Q15345 812 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 RNF180Q86T96 592 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 ADCY6O43306 1168 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 PGK1P00558 417 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 RCAN1P53805 252 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 GHRHRQ02643 423 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 PDE4DQ08499 809 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 RUFY3Q7L099 469 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 COL20A1Q9P218 1284 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 HSD17B4P51659 736 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 APOBRQ0VD83 1088 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTS4O75173 837 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 EDNRBP24530 442 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 TNFAIP2Q03169 654 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 FBXL16Q8N461 479 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 RMDN3Q96TC7 470 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 EVI5O60447 810 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 SPC25Q9HBM1 224 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 NID2Q14112 1375 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 POLR2MP0CAP2 368 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 PXMP2Q9NR77 195 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.02■■□□□ 1.44
NELFE-208ENST00000481121 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
NELFE-208ENST00000481121 GJA9P57773 515 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms