RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 SEC23AQ15436 765 aa31.16■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa31.16■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 ADGRF4Q8IZF3 695 aa31.16■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 BADQ92934 168 aa31.16■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 USH1GQ495M9 461 aa31.15■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa31.15■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 EEPD1Q7L9B9 569 aa31.15■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 VTI1AQ96AJ9 217 aa31.15■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa31.15■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 TMEM39AQ9NV64 488 aa31.15■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 CDK7P50613 346 aa31.14■■■□□ 2.58
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ODC1-204ENST00000446285 CPVLQ9H3G5 476 aa31.14■■■□□ 2.58
ODC1-204ENST00000446285 PDGFCQ9NRA1 345 aa31.14■■■□□ 2.58
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ODC1-204ENST00000446285 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 RAG1P15918 1043 aa31.13■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 FAAP100Q0VG06 881 aa31.13■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 DUSP28Q4G0W2 176 aa31.13■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 CYB5R4Q7L1T6 521 aa31.13■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 MCF2L2Q86YR7 1114 aa31.13■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 NCOA7Q8NI08 942 aa31.13■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 ERICH2A1L162 156 aa31.12■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 EDNRBP24530 442 aa31.12■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 PDE4DQ08499 809 aa31.12■■■□□ 2.57
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ODC1-204ENST00000446285 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 BEX3Q00994 111 aa31.11■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 QRICH1Q2TAL8 776 aa31.11■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 FBXO11Q86XK2 927 aa31.11■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 WDR11Q9BZH6 1224 aa31.11■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 JMJD4Q9H9V9 463 aa31.11■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 TLR3O15455 904 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 E7EWF7 191 aa31.09■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP31.09■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 TBX21Q9UL17 535 aa31.09■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 KLRF2D3W0D1 207 aa31.08■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 CXCL17Q6UXB2 119 aa31.08■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 SCFD2Q8WU76 684 aa31.08■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 AMNQ9BXJ7 453 aa31.08■■■□□ 2.57
ODC1-204ENST00000446285 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
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ODC1-204ENST00000446285 ITGB8P26012 769 aa31.07■■■□□ 2.56
ODC1-204ENST00000446285 TRAF1Q13077 416 aa31.07■■■□□ 2.56
ODC1-204ENST00000446285 WTAPQ15007 396 aa31.07■■■□□ 2.56
ODC1-204ENST00000446285 SHHQ15465 462 aa31.07■■■□□ 2.56
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ODC1-204ENST00000446285 MAD2L2Q9UI95 211 aa31.07■■■□□ 2.56
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ODC1-204ENST00000446285 MTA3Q9BTC8 594 aa31.05■■■□□ 2.56
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ODC1-204ENST00000446285 STOX1Q6ZVD7 989 aa31.03■■■□□ 2.56
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ODC1-204ENST00000446285 CD4P01730 458 aa31.02■■■□□ 2.56
ODC1-204ENST00000446285 BMP2KLQ5H9B9 411 aa31.02■■■□□ 2.56
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ODC1-204ENST00000446285 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
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ODC1-204ENST00000446285 PTGS1P23219 599 aa31.01■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 TROAPQ12815 778 aa31.01■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 TBC1D5Q92609 795 aa31.01■■■□□ 2.55
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ODC1-204ENST00000446285 KPNA6O60684 536 aa31■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP31■■■□□ 2.55
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