RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 CES2O00748 559 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 MYZAPP0CAP1 466 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 FGFR2P21802 821 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 GRIN1Q05586 938 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 SEC23AQ15436 765 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 PTPN21Q16825 1174 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 CABP7Q86V35 215 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 PBKQ96KB5 322 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 SH3GL2Q99962 352 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 SH2D4AQ9H788 454 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-202ENST00000320122 TSPY2A6NKD2 308 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 PJA2O43164 708 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 GBP1P32455 592 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 LIG3P49916 1009 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 NEDD9Q14511 834 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 SLMAPQ14BN4 828 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 PI16Q6UXB8 463 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 CHP1Q99653 195 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 EPN3Q9H201 632 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 B4DLN1 442 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 ENC1O14682 589 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 FSBPO95073 299 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 KIF11P52732 1056 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 HERVK_113P62684 666 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 RASGRF1Q13972 1273 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 UBE4AQ14139 1066 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 USP49Q70CQ1 688 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 DGKHQ86XP1 1220 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 ABCF2Q9UG63 623 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 TNS2Q63HR2 1409 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 A0A1B0GUA9 196 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 CCDC188H7C350 402 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 OR52Z1P0C646 297 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 NR1D1P20393 614 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 GPTP24298 496 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 ODF2Q5BJF6 829 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 PACS2Q86VP3 889 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 LCORLQ8N3X6 602 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 ATRIPQ8WXE1 791 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 CCDC114Q96M63 670 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 STK24Q9Y6E0 443 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 MARCH6O60337 910 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 SFMBT2Q5VUG0 894 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 HOOK3Q86VS8 718 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 LRP6O75581 1613 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 EXOC5O00471 708 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 PPP1R37O75864 691 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 SERPING1P05155 500 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 LDHCP07864 332 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 GSTO1P78417 241 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 DDR1Q08345 913 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 C2orf54Q08AI8 447 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 TTI2Q6NXR4 508 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 BRINP3Q76B58 766 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-202ENST00000320122 MED15Q96RN5 788 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms