RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 LRRC41Q15345 812 aa21.16■□□□□ 0.98
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PTX4-201ENST00000293922 PRO3102Q9H379 93 aa21.16■□□□□ 0.98
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PTX4-201ENST00000293922 CALM1P0DP23 149 aa21.15■□□□□ 0.98
PTX4-201ENST00000293922 CALM2P0DP24 149 aa21.15■□□□□ 0.98
PTX4-201ENST00000293922 CALM3P0DP25 149 aa21.15■□□□□ 0.98
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PTX4-201ENST00000293922 ARMCX2Q7L311 632 aa21.15■□□□□ 0.98
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PTX4-201ENST00000293922 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.15■□□□□ 0.98
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PTX4-201ENST00000293922 CPVLQ9H3G5 476 aa21.14■□□□□ 0.98
PTX4-201ENST00000293922 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
PTX4-201ENST00000293922 ASTN1O14525 1302 aa21.14■□□□□ 0.97
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PTX4-201ENST00000293922 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.97
PTX4-201ENST00000293922 RTP1P59025 263 aa21.08■□□□□ 0.97
PTX4-201ENST00000293922 SNX17Q15036 470 aa21.08■□□□□ 0.97
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PTX4-201ENST00000293922 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.08■□□□□ 0.97
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