RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-209ENST00000547449 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-209ENST00000547449 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-209ENST00000547449 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-209ENST00000547449 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-209ENST00000547449 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-209ENST00000547449 OR52Z1P0C646 297 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 IKQ13123 557 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 IQUBQ8NA54 791 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 MTMR9Q96QG7 549 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 A0A087X0B3 334 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 PIK3CDO00329 1044 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 MEIS2O14770 477 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 NEMFO60524 1076 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 CYP3A7P24462 503 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 TXLNAP40222 546 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 USP14P54578 494 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 PNOCQ13519 176 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 PDIA5Q14554 519 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 POSTNQ15063 836 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 E2F4Q16254 413 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 UBE2SQ16763 222 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 HS1BP3Q53T59 392 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 MOXD1Q6UVY6 613 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 SCYL3Q8IZE3 742 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 SPATA20Q8TB22 786 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 DHX58Q96C10 678 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 PAGE5Q96GU1 130 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 MBOAT7Q96N66 472 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 RNF181Q9P0P0 153 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 MYH6P13533 1939 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 USP17L15C9J2P7 530 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 USP17L11C9JVI0 530 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 USP17L18D6R9N7 530 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 USP17L22D6RA61 530 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 USP17L19D6RCP7 530 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 USP17L20D6RJB6 530 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 SMC2O95347 1197 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 INPP5BP32019 993 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 UBA7P41226 1012 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 SNAP25P60880 206 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 USP17L24Q0WX57 530 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 LUZP1Q86V48 1076 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 PDILTQ8N807 584 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 SMARCE1Q969G3 411 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 KLRG1Q96E93 195 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 FEZ1Q99689 392 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 ANO3Q9BYT9 981 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 GGA3Q9NZ52 723 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 CCDC39Q9UFE4 941 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 PNMA2Q9UL42 364 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 MYH8P13535 1937 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 SMTNL1A8MU46 457 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 C19orf81C9J6K1 198 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 OPLAHO14841 1288 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 FOXN1O15353 648 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 ADCY5O95622 1261 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 FDX1P10109 184 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 BACE1P56817 501 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 SEMA3FQ13275 785 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 MORC3Q14149 939 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 CALCRLQ16602 461 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 IGSF22Q8N9C0 903 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-209ENST00000547449 MLKLQ8NB16 471 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms