RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	CALM1	P0DP23	149 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	CALM2	P0DP24	149 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	CALM3	P0DP25	149 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	CALML3	P27482	149 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	GNAQ	P50148	359 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	ACVR2B	Q13705	512 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	USH1G	Q495M9	461 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	IL25	Q9H293	177 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF536	O15090	1300 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE4D	Q08499	809 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246		H0YGN5	161 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC27A2	O14975	620 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	PRC1	O43663	620 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	DDAH1	O94760	285 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC23A	Q15436	765 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	GRM4	Q14833	912 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC41	Q15345	812 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB5	O15062	677 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHA2	P01877	340 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	LIFR	P42702	1097 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	CUL5	Q93034	780 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-231	ENST00000496246	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	NFIB	O00712	420 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	PGK1	P00558	417 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	COL6A1	P12109	1028 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMA5	P28066	241 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-231	ENST00000496246	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31

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