RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 JADE2Q9NQC1 790 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L12C9JPN9 530 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L21D6R901 530 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 MCM7P33993 719 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 STAT6P42226 847 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 RETREG2Q8NC44 543 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF384Q8TF68 577 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 DUOX1Q9NRD9 1551 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ERLIN2O94905 339 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 TAF1P21675 1872 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
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TOP3B-206ENST00000436282 TMTC3Q6ZXV5 915 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM47Q96LD4 638 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 DRC1Q96MC2 740 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 FAM169AQ9Y6X4 670 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 11.9
TOP3B-206ENST00000436282 TROAPQ12815 778 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 KCNB1Q14721 858 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 NGLY1Q96IV0 654 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 NLRP3Q96P20 1036 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SETDB2Q96T68 719 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SH3GL2Q99962 352 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 TSGA10Q9BZW7 698 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 EXOC1Q9NV70 894 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 GNPATO15228 680 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 VAV2P52735 878 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 ZBED6P86452 979 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 KIF5AQ12840 1032 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 GRIN2DO15399 1336 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SHTN1A0MZ66 631 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 B4DLN1 442 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 PSMA7O14818 248 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 DDAH1O94760 285 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 BCAS4Q8TDM0 211 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 SNX12Q9UMY4 172 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-206ENST00000436282 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 OPA1O60313 960 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 PRDX5P30044 214 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 CDK17Q00537 523 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 MECOMQ03112 1051 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 IQCA1Q86XH1 822 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 CREG2Q8IUH2 290 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 DISC1Q9NRI5 854 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 NMT2O60551 498 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 NLRP5P59047 1200 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 FAM47AQ5JRC9 791 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 TTI2Q6NXR4 508 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM58Q8NG06 486 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.64■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 RASSF10A6NK89 507 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 ZPR1O75312 459 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 LIG3P49916 1009 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 GNGT1P63211 74 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 SEMA3FQ13275 785 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 MCTP2Q6DN12 878 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 PHLPP1O60346 1717 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 KLRC4O43908 158 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 MYL1P05976 194 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 CYP2D6P10635 497 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 SCG2P13521 617 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 PRLRP16471 622 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 CYP27A1Q02318 531 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 SLC51AQ86UW1 340 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 POTEDQ86YR6 584 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 KAT2BQ92831 832 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC1Q9BTT6 524 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 EHD4Q9H223 541 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-206ENST00000436282 WNK3Q9BYP7 1800 aa16.63■□□□□ 0.25
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