RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	THAP11	Q96EK4	314 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	TINF2	Q9BSI4	451 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	CTAGE5	O15320	804 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	STRN	O43815	780 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	LPXN	O60711	386 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASGR1	P07306	291 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	CA3	P07451	260 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	SHMT1	P34896	483 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	GSTO1	P78417	241 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	TTLL4	Q14679	1199 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	AAK1	Q2M2I8	961 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM199	Q8N511	208 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCLY	Q96I15	445 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYH1	P12882	1939 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF521	Q96K83	1311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRR33	A8MZF0	331 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	CD4	P01730	458 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	GCGR	P47871	477 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLCD1	P51178	756 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	BEX3	Q00994	111 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	COG2	Q14746	738 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	HLA-C	Q95604	372 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCN5A	Q14524	2016 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRIN2D	O15399	1336 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	PARP14	Q460N5	1801 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARVCF	O00192	962 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	AKR1A1	P14550	325 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL9	P15248	144 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	USP14	P54578	494 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	FUT2	Q10981	343 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRB10	Q13322	594 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	WDR63	Q8IWG1	891 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	NLRP7	Q8WX94	980 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	COPRS	Q9NQ92	184 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	GINM1	Q9NU53	330 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	MCM3AP	O60318	1980 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	TAP1	Q03518	808 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	MMP19	Q99542	508 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	COG5	Q9UP83	839 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASTN1	O14525	1302 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	USP34	Q70CQ2	3546 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	FCER1A	P12319	257 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	GJD3	Q8N144	294 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	FGD4	Q96M96	766 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIPK3	Q9H422	1215 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	MROH8	Q9H579	483 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		10.59	□□□□□ -0.71
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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