RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 MAP7D2Q96T17 732 aa24.49■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 GDAQ9Y2T3 454 aa24.49■■□□□ 1.51
SPHK1-201ENST00000323374 TEX33O43247 280 aa24.49■■□□□ 1.51
SPHK1-201ENST00000323374 SLURP2P0DP57 97 aa24.49■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 AOC3Q16853 763 aa24.49■■□□□ 1.51
SPHK1-201ENST00000323374 KCTD1Q719H9 257 aa24.49■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 STX10O60499 249 aa24.48■■□□□ 1.51
SPHK1-201ENST00000323374 PRCPP42785 496 aa24.48■■□□□ 1.51
SPHK1-201ENST00000323374 CALCRLQ16602 461 aa24.48■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.48■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.48■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 ADSSL1Q8N142 457 aa24.47■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 RHOBTB3O94955 611 aa24.47■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.47■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.46■■□□□ 1.51
SPHK1-201ENST00000323374 USP17L10C9JJH3 530 aa24.46■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 TXKP42681 527 aa24.46■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 CALML4Q96GE6 196 aa24.46■■□□□ 1.51
SPHK1-201ENST00000323374 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.46■■□□□ 1.51
SPHK1-201ENST00000323374 FAM196BA6NMK8 535 aa24.46■■□□□ 1.51
SPHK1-201ENST00000323374 STIM1Q13586 685 aa24.46■■□□□ 1.51
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.46■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 DCAF4Q8WV16 495 aa24.46■■□□□ 1.51
SPHK1-201ENST00000323374 STK32BQ9NY57 414 aa24.46■■□□□ 1.51
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SPHK1-201ENST00000323374 H7C1D1 291 aa24.45■■□□□ 1.5
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SPHK1-201ENST00000323374 TNNI2P48788 182 aa24.44■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 AMPD3Q01432 767 aa24.44■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 KRT31Q15323 416 aa24.44■■□□□ 1.5
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SPHK1-201ENST00000323374 SIPA1L1O43166 1804 aa24.44■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 SLC37A4O43826 429 aa24.44■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 TDP2O95551 362 aa24.44■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 TCP11X2Q5H9J9 407 aa24.44■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.44■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.44■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM9Q9C026 710 aa24.44■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.44■■□□□ 1.5
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SPHK1-201ENST00000323374 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
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SPHK1-201ENST00000323374 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
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SPHK1-201ENST00000323374 KCNJ18B7U540 433 aa24.43■■□□□ 1.5
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SPHK1-201ENST00000323374 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.43■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 PSMA7O14818 248 aa24.42■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 PPIP5K2O43314 1243 aa24.42■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 ICA1Q05084 483 aa24.42■■□□□ 1.5
SPHK1-201ENST00000323374 RBL2Q08999 1139 aa24.42■■□□□ 1.5
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