RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296122.10

PPP1CB-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CB, Length 3,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-201ENST00000296122 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 HACL1Q9UJ83 578 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 SNAP25P60880 206 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 VCPKMTQ9H867 229 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 NOVP48745 357 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP49Q70CQ1 688 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 STAMQ92783 540 aa14.86□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 PRPHP41219 470 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 ECE1P42892 770 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 NPY5RQ15761 445 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 ACER1Q8TDN7 264 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 TMX2Q9Y320 296 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 TBC1D12O60347 775 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 CDC25AP30304 524 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 AP3B2Q13367 1082 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 ERMNQ8TAM6 284 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 RNF181Q9P0P0 153 aa14.85□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP17L15C9J2P7 530 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP17L11C9JVI0 530 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP17L18D6R9N7 530 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP17L22D6RA61 530 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP17L19D6RCP7 530 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP17L20D6RJB6 530 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP17L24Q0WX57 530 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 ANO3Q9BYT9 981 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 USP14P54578 494 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 FEM1BQ9UK73 627 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 NF2P35240 595 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 CPXCR1Q8N123 301 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 MYH6P13533 1939 aa14.84□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 TPM2P07951 284 aa14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 POLR2MP0CAP2 368 aa14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 ASIC1P78348 528 aa14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 PRKG1Q13976 671 aa14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 SULF1Q8IWU6 871 aa14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 SHISA4Q96DD7 197 aa14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 GSDMAQ96QA5 445 aa14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PPP1CB-201ENST00000296122 LTBP1Q14766 1721 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 ZNF75DP51815 510 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 PAGE5Q96GU1 130 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 GINM1Q9NU53 330 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 FLOT1O75955 427 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 WRNIP1Q96S55 665 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 DISC1Q9NRI5 854 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 EXOC1Q9NV70 894 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.83□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 ZBED4O75132 1171 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 CUEDC2Q9H467 287 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 SHTN1A0MZ66 631 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 IDEP14735 1019 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 SV2BQ7L1I2 683 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 GGA3Q9NZ52 723 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 FOXN1O15353 648 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 POTEDQ86YR6 584 aa14.82□□□□□ -0.04
PPP1CB-201ENST00000296122 LPAR1Q92633 364 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms