RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 VAT1LQ9HCJ6 419 aa35.76■■■■□ 3.32
INO80B-201ENST00000233331 MAD2L2Q9UI95 211 aa35.76■■■■□ 3.32
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INO80B-201ENST00000233331 MCM5P33992 734 aa35.75■■■■□ 3.31
INO80B-201ENST00000233331 GRM4Q14833 912 aa35.75■■■■□ 3.31
INO80B-201ENST00000233331 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa35.75■■■■□ 3.31
INO80B-201ENST00000233331 CLEC4DQ8WXI8 215 aa35.75■■■■□ 3.31
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INO80B-201ENST00000233331 NR2E3Q9Y5X4 410 aa35.72■■■■□ 3.31
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INO80B-201ENST00000233331 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
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INO80B-201ENST00000233331 NFXL1Q6ZNB6 911 aa35.69■■■■□ 3.3
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INO80B-201ENST00000233331 ZNF654Q8IZM8 581 aa35.69■■■■□ 3.3
INO80B-201ENST00000233331 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
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INO80B-201ENST00000233331 CEP290O15078 2479 aa35.67■■■■□ 3.3
INO80B-201ENST00000233331 CCDC69A6NI79 296 aa35.66■■■■□ 3.3
INO80B-201ENST00000233331 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
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INO80B-201ENST00000233331 RNF180Q86T96 592 aa35.65■■■■□ 3.3
INO80B-201ENST00000233331 HOMER1Q86YM7 354 aa35.65■■■■□ 3.3
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INO80B-201ENST00000233331 MTMR8Q96EF0 704 aa35.65■■■■□ 3.3
INO80B-201ENST00000233331 AMNQ9BXJ7 453 aa35.65■■■■□ 3.3
INO80B-201ENST00000233331 ZBTB5O15062 677 aa35.64■■■■□ 3.3
INO80B-201ENST00000233331 LRRC26Q2I0M4 334 aa35.64■■■■□ 3.3
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INO80B-201ENST00000233331 ADCY6O43306 1168 aa35.62■■■■□ 3.29
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INO80B-201ENST00000233331 MAP3K14Q99558 947 aa35.62■■■■□ 3.29
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INO80B-201ENST00000233331 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
INO80B-201ENST00000233331 ADAMTS4O75173 837 aa35.61■■■■□ 3.29
INO80B-201ENST00000233331 REC8O95072 547 aa35.61■■■■□ 3.29
INO80B-201ENST00000233331 KIF5BP33176 963 aa35.61■■■■□ 3.29
INO80B-201ENST00000233331 MCF2L2Q86YR7 1114 aa35.61■■■■□ 3.29
INO80B-201ENST00000233331 TBC1D5Q92609 795 aa35.61■■■■□ 3.29
INO80B-201ENST00000233331 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa35.6■■■■□ 3.29
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