RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 MYH8P13535 1937 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 SMIM22K7EJ46 135 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 STRNO43815 780 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 RASA1P20936 1047 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 STOX1Q6ZVD7 989 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC44A5Q8NCS7 719 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 FEZ1Q99689 392 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 TOMM22Q9NS69 142 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 PHF24Q9UPV7 400 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 NEDD4P46934 1319 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPNS1-214ENST00000592483 USP14P54578 494 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 NEK1Q96PY6 1258 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 MTA3Q9BTC8 594 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF6LQ9Y6J9 622 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 PLIN4Q96Q06 1357 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 GH2P01242 217 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 ADORA2AP29274 412 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 STK11IPQ8N1F8 1099 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR19Q8NEZ3 1342 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 VCAM1P19320 739 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC178Q5BJE1 867 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 CABP5Q9NP86 173 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPY2A6NKD2 308 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
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CAPNS1-214ENST00000592483 PRDM1O75626 825 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM47AQ5JRC9 791 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 PRDM12Q9H4Q4 367 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM39AQ9NV64 488 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC5A4Q9NY91 659 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF236Q9UL36 1845 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 B4E1Z4 1266 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPY3P0CV98 308 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPY8P0CW00 308 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 MCM5P33992 734 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM179Q6ZVK1 233 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 IQCA1Q86XH1 822 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 NEDD1Q8NHV4 660 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 KDM4AO75164 1064 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 ADCK5Q3MIX3 580 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 INCENPQ9NQS7 918 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 COBLO75128 1261 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 TFAP4Q01664 338 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 SART3Q15020 963 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 TOX2Q96NM4 488 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 PBX4Q9BYU1 374 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-214ENST00000592483 PIEZO1Q92508 2521 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 AKR1B1P15121 316 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 CASTP20810 708 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF180Q86T96 592 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 SHCBP1Q8NEM2 672 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.012e-9■□□□□ 9
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CAPNS1-214ENST00000592483 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS6KB1P23443 525 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 PBX2P40425 430 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 FAAP100Q0VG06 881 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRE1Q14246 886 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 RABEP1Q15276 862 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 RUFY3Q7L099 469 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM87BQ96K49 555 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 UBAC1Q9BSL1 405 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 CHD9Q3L8U1 2897 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 RARBP10826 455 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 KANSL2Q9H9L4 492 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXC10Q9NYD6 342 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 NRBP1Q9UHY1 535 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 SMCHD1A6NHR9 2005 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PQY0 241 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 ERICH2A1L162 156 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 DCDC2CA8MYV0 355 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 TIMP1P01033 207 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 ERCC3P19447 782 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 ABRAQ8N0Z2 381 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXL16Q8N461 479 aa27.6■■■□□ 2.01
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