RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.79■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 CYP2C19P33261 490 aa21.79■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 GJA8P48165 433 aa21.79■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.79■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 IGHA2P01877 340 aa21.78■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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GCSHP2-201ENST00000560971 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.78■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.78■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ERICH2A1L162 156 aa21.77■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SGPL1O95470 568 aa21.77■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ALAS1P13196 640 aa21.77■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.77■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.77■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 CHST13Q8NET6 341 aa21.77■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.77■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 MAML3Q96JK9 1138 aa21.77■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF146Q9NTX7 359 aa21.77■■□□□ 1.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PRC1O43663 620 aa21.76■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 WTAPQ15007 396 aa21.76■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.76■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.76■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX11Q96FC9 970 aa21.76■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.76■■□□□ 1.07
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GCSHP2-201ENST00000560971 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.76■■□□□ 1.07
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GCSHP2-201ENST00000560971 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.75■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.75■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF20Q5VTR2 975 aa21.75■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 RASEFQ8IZ41 740 aa21.75■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.75■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 TRPV1Q8NER1 839 aa21.75■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 ACAD9Q9H845 621 aa21.75■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.74■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 MCM5P33992 734 aa21.74■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 TKFCQ3LXA3 575 aa21.74■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.74■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.73■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.73■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 LY9Q9HBG7 655 aa21.73■■□□□ 1.07
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GCSHP2-201ENST00000560971 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 CYBAP13498 195 aa21.72■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 CNGA1P29973 690 aa21.72■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.72■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 TINF2Q9BSI4 451 aa21.72■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.72■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.72■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 KLRF2D3W0D1 207 aa21.71■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 CNTN2Q02246 1040 aa21.71■■□□□ 1.07
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GCSHP2-201ENST00000560971 FGD4Q96M96 766 aa21.71■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.71■■□□□ 1.07
GCSHP2-201ENST00000560971 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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GCSHP2-201ENST00000560971 GRM4Q14833 912 aa21.7■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.7■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 LHX8Q68G74 356 aa21.7■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.7■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM87BQ96K49 555 aa21.7■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 NEK1Q96PY6 1258 aa21.7■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 POTEB2H3BUK9 544 aa21.69■■□□□ 1.06
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GCSHP2-201ENST00000560971 USH1GQ495M9 461 aa21.69■■□□□ 1.06
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GCSHP2-201ENST00000560971 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.69■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.69■■□□□ 1.06
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GCSHP2-201ENST00000560971 MTA3Q9BTC8 594 aa21.69■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 MYL10Q9BUA6 226 aa21.69■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.69■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 OGDHLQ9ULD0 1010 aa21.69■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.69■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.68■■□□□ 1.06
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GCSHP2-201ENST00000560971 HSPA4P34932 840 aa21.68■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.68■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.68■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.68■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.68■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.68■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNB2Q92953 911 aa21.68■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.68■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
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