RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552296.6

PCBP2-222, Transcript of poly(rC) binding protein 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PCBP2, Length 1,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP2-222	ENST00000552296	GJA9	P57773	515 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	ACVR2B	Q13705	512 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	TMEM240	Q5SV17	173 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	MFSD5	Q6N075	450 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	ASTN1	O14525	1302 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	ASGR1	P07306	291 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	VWCE	Q96DN2	955 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF576	Q9H609	170 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF536	O15090	1300 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	ARVCF	O00192	962 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	MS4A1	P11836	297 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	PBX2	P40425	430 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	OAZ1	P54368	228 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	ARMCX2	Q7L311	632 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	CEP95	Q96GE4	821 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	PBX4	Q9BYU1	374 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	TET1	Q8NFU7	2136 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	GRIN2D	O15399	1336 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	CSF2RA	P15509	400 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	CNTN2	Q02246	1040 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	CPXCR1	Q8N123	301 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	APPBP2	Q92624	585 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	TIFA	Q96CG3	184 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	DDX11	Q96FC9	970 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	FEM1B	Q9UK73	627 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PCBP2-222	ENST00000552296		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296		M0R2C6	588 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	FOXP2	O15409	715 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	GPAA1	O43292	621 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	RAD21	O60216	631 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ZBED4	O75132	1171 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PRDM1	O75626	825 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PTGS1	P23219	599 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71	3e-8	■□□□□ 10.7
PCBP2-222	ENST00000552296	ADGRE1	Q14246	886 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF365	Q70YC5	407 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	KIFC2	Q96AC6	838 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TTLL1	O95922	423 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ACR	P10323	421 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	BEX3	Q00994	111 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	HERVK_113	Q902F9	699 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	BCL11A	Q9H165	835 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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