RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.64■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PEAK1Q9H792 1746 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 KLK7P49862 253 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 RAPGEF5Q92565 580 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 SMIM24O75264 130 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 KRT83P78385 493 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 NEFHP12036 1026 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PTPREP23469 700 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 NR5A1Q13285 461 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 KIF5AQ12840 1032 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 KSR2Q6VAB6 950 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 MDM1Q8TC05 714 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 FAM210AQ96ND0 272 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 TSC22D3Q99576 134 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 ERICH2A1L162 156 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PRPHP41219 470 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 KCNJ2P63252 427 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 ANO9A1A5B4 782 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 TTC36A6NLP5 189 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PPIP5K2O43314 1243 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PAK2Q13177 524 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 ERICH1Q86X53 443 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 SPATA20Q8TB22 786 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PAGE5Q96GU1 130 aa20.61■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 EVI5O60447 810 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 ATP4AP20648 1035 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 TIMM10P62072 90 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 GUCY1A2P33402 732 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 WASHC4Q2M389 1173 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 OSBP2Q969R2 916 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 EPAS1Q99814 870 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 DLC1Q96QB1 1528 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 TRIM37O94972 964 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PYGBP11216 843 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 SLC39A6Q13433 755 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 IFT20Q8IY31 132 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 ZNF263O14978 683 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 ACEP12821 1306 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 DPPA5A6NC42 116 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 FESP07332 822 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 MYZAPP0CAP1 466 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-205ENST00000527224 PAFAH1B1P43034 410 aa20.59■□□□□ 0.89
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