RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC181Q5TID7 509 aa6.31□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.31□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.31□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.31□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.31□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.31□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.31□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.31□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 FGRP09769 529 aa6.3□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 YY1P25490 414 aa6.3□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.3□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF394Q53GI3 561 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.3□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 CHST3Q7LGC8 479 aa6.3□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 GJD3Q8N144 294 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 TEPSINQ96N21 525 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 NEK1Q96PY6 1258 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 TOMM22Q9NS69 142 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 GGA3Q9NZ52 723 aa6.3□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 CNTNAP1P78357 1384 aa6.3□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAF5O00463 557 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 HLA-DOAP06340 250 aa6.29□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 PDE4BQ07343 736 aa6.29□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 TNFAIP1Q13829 316 aa6.29□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 AGERQ15109 404 aa6.29□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 TNS4Q8IZW8 715 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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MSC-AS1-205ENST00000519068 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 CSRNP1Q96S65 589 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPSB2Q99619 263 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIF2CQ99661 725 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPME1Q9Y570 386 aa6.29□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 UTRNP46939 3433 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 B4E1Z4 1266 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
MSC-AS1-205ENST00000519068 SNPHO15079 494 aa6.28□□□□□ -1.4
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